La historia de School Days nos presenta a Makoto un muchacho de colegio que esta enamorado de Katsura Kotonoha, cada dia ambos regresan a su casa en el mismo tren, el la observa pero no se le puede declarar. Hasta q un día en su clase una de sus compañeras Sekai descubre la verdad de Makoto y le ofrece ayudarle a declarar su amor por Kotonoha. Cuando finalmente Makoto consigue una cita con Kotonoha el intenta hacer esto eso y aquello, pero Kotonoha se asusta. Entonces Makoto le cuenta lo sucedido a Sekai y ella (como esta enamorada de el) le dice que practicara con el para que despues pueda hacerlo con Kotonoha, pero de ahí en adelante Makoto descubre que quiere estar con la Sekai y cambia su vida por completo, solo busca la diversion y se acuesta con todas sus compañeras, por otro lado Kotonoha se aferra a decir que es novia de Makoto y entra en una depresion total, hasta que un día Sekai "descubre" que esta embarazada y se lo cuenta a

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